La gestión del subprograma de los Premios a la Calidad e Innovación en la Gestión Pública  corresponde a la Secretaría General para la Administración Pública, si bien la Agencia Estatal de Evaluación de las Políticas Públicas y la Calidad de los Servicios es responsable de la difusión de experiencias y buenas prácticas en el ámbito de sus competencias.
 
En 1999 se instituyen el Premio a la Calidad y los Premios a las Mejores Prácticas en la Administración General del Estado, de los que se han completado 4 ediciones y que constituyen el antecedente de los actuales Premios. Puede accederse a los resúmenes de las memorias de las organizaciones galardonadas con el Premio a la Calidad y los Premios a las Mejores Prácticas en la Administración General del Estado, así como a la información de contacto con las organizaciones en la Recopilación de los Premios a la Calidad y a las Mejores prácticas.
 
En 2005 se sustituyen dichos premios por los Premios a la Calidad e Innovación en la Gestión Pública, en virtud de lo establecido en el Real Decreto 951/2005, por el que se establece el marco general para la mejora de la calidad en la Administración General del Estado.
 
Mediante la Orden APU/486/2006, de 14 de febrero, por la que se regulan los Premios a la Calidad e Innovación en la Gestión Pública, se convocaron por el Ministerio de Administraciones Públicas los correspondientes a 2006 (Excelencia, Tecnimap y Buenas Prácticas).
 
Próximamente estarán disponibles los resúmenes de las memorias de las organizaciones galardonadas por el Ministerio de Administraciones Públicas con el Premio a la Excelencia, el Premio Ciudadanía a las Buenas Prácticas en los servicios públicos y el Premio a las Buenas Prácticas de Gestión Interna, así como la información de contacto con las organizaciones.